Improved "project.index" file for PHPdoc TextHover information
[phpeclipse.git] / net.sourceforge.phpeclipse / src / net / sourceforge / phpeclipse / PHPeclipsePlugin.java
index 152ca9a..70785ae 100644 (file)
@@ -11,8 +11,22 @@ Contributors:
 **********************************************************************/
 package net.sourceforge.phpeclipse;
 
+import java.io.File;
+import java.util.Collection;
+import java.util.HashMap;
+import java.util.Iterator;
+
+import net.sourceforge.phpdt.externaltools.internal.model.ColorManager;
+import net.sourceforge.phpdt.externaltools.internal.model.ExternalToolsPlugin;
+import net.sourceforge.phpdt.externaltools.internal.model.VariableContextManager;
 import net.sourceforge.phpdt.internal.ui.preferences.TemplatePreferencePage;
 import net.sourceforge.phpdt.internal.ui.viewsupport.ImageDescriptorRegistry;
+import net.sourceforge.phpdt.ui.PreferenceConstants;
+import net.sourceforge.phpdt.ui.text.JavaTextTools;
+import net.sourceforge.phpeclipse.builder.ExternalEditorInput;
+import net.sourceforge.phpeclipse.builder.ExternalStorageDocumentProvider;
+import net.sourceforge.phpeclipse.builder.FileStorage;
+import net.sourceforge.phpeclipse.builder.IdentifierIndexManager;
 import net.sourceforge.phpeclipse.phpeditor.PHPDocumentProvider;
 import net.sourceforge.phpeclipse.phpeditor.PHPSyntaxRdr;
 import net.sourceforge.phpeclipse.phpeditor.util.PHPColorProvider;
@@ -20,6 +34,9 @@ import net.sourceforge.phpeclipse.resourcesview.PHPElement;
 import net.sourceforge.phpeclipse.resourcesview.PHPElementAdapterFactory;
 import net.sourceforge.phpeclipse.resourcesview.ResourceAdapterFactory;
 
+import org.eclipse.core.boot.BootLoader;
+import org.eclipse.core.resources.IFile;
+import org.eclipse.core.resources.IProject;
 import org.eclipse.core.resources.IResource;
 import org.eclipse.core.resources.IWorkspace;
 import org.eclipse.core.resources.ResourcesPlugin;
@@ -33,44 +50,44 @@ import org.eclipse.core.runtime.Platform;
 import org.eclipse.core.runtime.Status;
 import org.eclipse.jface.preference.IPreferenceStore;
 import org.eclipse.jface.preference.PreferenceConverter;
+import org.eclipse.jface.text.BadLocationException;
+import org.eclipse.jface.text.IDocument;
+import org.eclipse.swt.widgets.Display;
 import org.eclipse.swt.widgets.Shell;
+import org.eclipse.ui.IEditorDescriptor;
+import org.eclipse.ui.IEditorInput;
+import org.eclipse.ui.IEditorPart;
+import org.eclipse.ui.IEditorRegistry;
+import org.eclipse.ui.IWorkbench;
 import org.eclipse.ui.IWorkbenchPage;
 import org.eclipse.ui.IWorkbenchWindow;
+import org.eclipse.ui.PlatformUI;
 import org.eclipse.ui.plugin.AbstractUIPlugin;
+import org.eclipse.ui.texteditor.IDocumentProvider;
+import org.eclipse.ui.texteditor.ITextEditor;
 
 /**
  * The main plugin class to be used in the desktop.
  */
 public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceConstants {
-  //   public static final String LOCALHOST_PREF = "_localhost";
-  //   public static final String DOCUMENTROOT_PREF = "_documentroot";
-  //   public static final String USE_EXTERNAL_BROWSER_PREF = "_use_external_browser";
-  //   public static final String EXTERNAL_BROWSER_PREF = "_external_browser";
-  //   public static final String MYSQL_PREF = "_my_sql";
-  //   public static final String APACHE_START_PREF = "_apache_start";
-  //   public static final String APACHE_STOP_PREF = "_apache_stop";
-  //   public static final String APACHE_RESTART_PREF = "_apache_restart";
-  //  public static final String SHOW_OUTPUT_IN_CONSOLE = "_sho_output_in_console";
-  //  public static final String EXTERNAL_PARSER_PREF = "_external_parser";
-
   /**
    * The id of the PHP plugin (value <code>"net.sourceforge.phpeclipse"</code>).
    */
   public static final String PLUGIN_ID = "net.sourceforge.phpeclipse"; //$NON-NLS-1$
-  public final static String PHP_NATURE_ID = PLUGIN_ID + ".phpnature";
- // public static final String PHP_RESOURCES_VIEW_ID = PLUGIN_ID + ".resourcesview.ViewPHPResources"; //$NON-NLS-1$
-  public static final String PHP_CODING_ACTION_SET_ID = PLUGIN_ID + ".ui.CodingActionSet"; //$NON-NLS-1$
 
+  /** 
+   * id of builder - matches plugin.xml (concatenate pluginid.builderid) 
+   */
+  public static final String BUILDER_INDEX_ID = PLUGIN_ID + ".indexbuilder";
+  public static final String BUILDER_PARSER_ID = PLUGIN_ID + ".parserbuilder";
 
-  //The shared instance.
-  private static PHPeclipsePlugin plugin;
-  //Resource bundle.
-  //private ResourceBundle resourceBundle;
+  /** General debug flag*/
+  public static final boolean DEBUG = false;
+
+  private static ExternalToolsPlugin externalTools;
 
-  private ImageDescriptorRegistry fImageDescriptorRegistry;
-  private PHPDocumentProvider fCompilationUnitDocumentProvider;
   /**
-  * The Java virtual machine that we are running on.  
+  * The Java virtual machine that we are running on.
   */
   private static int jvm;
 
@@ -86,14 +103,37 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
   /** MRJ 3.1 */
   private static final int MRJ_3_1 = 4;
 
-  /** Windows NT  */
-  private static final int WINDOWS_NT = 5;
+  /** JVM constant for any other platform */
+  private static final int OTHER = -1;
+
+  // public static final String PHP_RESOURCES_VIEW_ID = PLUGIN_ID + ".resourcesview.ViewPHPResources"; //$NON-NLS-1$
+  public static final String PHP_CODING_ACTION_SET_ID = PLUGIN_ID + ".ui.CodingActionSet"; //$NON-NLS-1$
+  public final static String PHP_NATURE_ID = PLUGIN_ID + ".phpnature";
+
+  public static final String PHPPARSER_ORIGINAL = "net.sourceforge.phpdt.internal.compiler.parser.Parser";
+
+  public static final String PHPPARSER_NEW = "test.PHPParser";
+
+  /** Change this if you want to switch PHP Parser. */
+  public static final String PHPPARSER = PHPPARSER_ORIGINAL;
+
+  //The shared instance.
+  private static PHPeclipsePlugin plugin;
 
   /** Windows 9x  */
   private static final int WINDOWS_9x = 6;
 
-  /** JVM constant for any other platform */
-  private static final int OTHER = -1;
+  /** Windows NT  */
+  private static final int WINDOWS_NT = 5;
+  private PHPDocumentProvider fCompilationUnitDocumentProvider;
+  //Resource bundle.
+  //private ResourceBundle resourceBundle;
+
+  private ImageDescriptorRegistry fImageDescriptorRegistry;
+  private HashMap fIndexManagerMap = new HashMap();
+
+  private JavaTextTools fJavaTextTools;
+  private IFile fLastEditorFile = null;
   /**
    * The constructor.
    */
@@ -101,6 +141,7 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     super(descriptor);
     plugin = this;
     setJVM();
+    externalTools = new ExternalToolsPlugin();
     //    try {
     //      resourceBundle = ResourceBundle.getBundle("net.sourceforge.PHPeclipsePluginResources");
     //    } catch (MissingResourceException x) {
@@ -108,57 +149,16 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     //    }
   }
 
-  public static ImageDescriptorRegistry getImageDescriptorRegistry() {
-    return getDefault().internalGetImageDescriptorRegistry();
+  public static IWorkbenchPage getActivePage() {
+    return getDefault().internalGetActivePage();
   }
 
-  private ImageDescriptorRegistry internalGetImageDescriptorRegistry() {
-    if (fImageDescriptorRegistry == null)
-      fImageDescriptorRegistry = new ImageDescriptorRegistry();
-    return fImageDescriptorRegistry;
-  }
-  // @TODO: refactor this into a better method name !
-  public PHPDocumentProvider getCompilationUnitDocumentProvider() {
-    if (fCompilationUnitDocumentProvider == null)
-      fCompilationUnitDocumentProvider = new PHPDocumentProvider();
-    return fCompilationUnitDocumentProvider;
+  public static Shell getActiveWorkbenchShell() {
+    return getActiveWorkbenchWindow().getShell();
   }
 
-  public static void setJVM() {
-    String osName = System.getProperty("os.name");
-
-    if (osName.startsWith("Mac OS")) {
-      String mrjVersion = System.getProperty("mrj.version");
-      String majorMRJVersion = mrjVersion.substring(0, 3);
-      jvm = OTHER;
-      try {
-
-        double version = Double.valueOf(majorMRJVersion).doubleValue();
-
-        if (version == 2) {
-          jvm = MRJ_2_0;
-        } else if (version >= 2.1 && version < 3) {
-          jvm = MRJ_2_1;
-        } else if (version == 3.0) {
-          jvm = MRJ_3_0;
-        } else if (version >= 3.1) {
-          jvm = MRJ_3_1;
-        }
-
-      } catch (NumberFormatException nfe) {
-
-      }
-
-    } else if (osName.startsWith("Windows")) {
-      if (osName.indexOf("9") != -1) {
-        jvm = WINDOWS_9x;
-      } else {
-        jvm = WINDOWS_NT;
-      }
-    }
-  }
-  public static int getJVM() {
-    return jvm;
+  public static IWorkbenchWindow getActiveWorkbenchWindow() {
+    return getDefault().getWorkbench().getActiveWorkbenchWindow();
   }
   /**
    * Returns the shared instance.
@@ -167,31 +167,46 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     return plugin;
   }
 
-  /**
-   * Returns the workspace instance.
-   */
-  public static IWorkspace getWorkspace() {
-    return ResourcesPlugin.getWorkspace();
+  public static ImageDescriptorRegistry getImageDescriptorRegistry() {
+    return getDefault().internalGetImageDescriptorRegistry();
   }
 
-  public static IWorkbenchPage getActivePage() {
-    return PHPeclipsePlugin.getActivePage();
+  static IPath getInstallLocation() {
+    return new Path(getDefault().getDescriptor().getInstallURL().getFile());
+  }
+  public static int getJVM() {
+    return jvm;
   }
 
-  public static IWorkbenchWindow getActiveWorkbenchWindow() {
-    return getDefault().getWorkbench().getActiveWorkbenchWindow();
+  public static String getPluginId() {
+    return getDefault().getDescriptor().getUniqueIdentifier();
   }
 
-  public static Shell getActiveWorkbenchShell() {
-    return getActiveWorkbenchWindow().getShell();
+  /**
+   * Returns the standard display to be used. The method first checks, if
+   * the thread calling this method has an associated display. If so, this
+   * display is returned. Otherwise the method returns the default display.
+   */
+  public static Display getStandardDisplay() {
+    Display display = Display.getCurrent();
+    if (display == null) {
+      display = Display.getDefault();
+    }
+    return display;
   }
 
-  public static String getPluginId() {
-    return getDefault().getDescriptor().getUniqueIdentifier();
+  //  public static ExternalToolsPlugin getExternalTools() {
+  //    return externalTools;
+  //  }
+  /**
+   * Returns the workspace instance.
+   */
+  public static IWorkspace getWorkspace() {
+    return ResourcesPlugin.getWorkspace();
   }
 
-  public static void log(IStatus status) {
-    getDefault().getLog().log(status);
+  public static boolean isDebug() {
+    return getDefault().isDebugging();
   }
 
   //  public static void logErrorMessage(String message) {
@@ -201,13 +216,13 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
   //  public static void logErrorStatus(String message, IStatus status) {
   //    if (status == null) {
   //      logErrorMessage(message);
-  //      return; 
+  //      return;
   //    }
   //    MultiStatus multi= new MultiStatus(getPluginId(), JavaStatusConstants.INTERNAL_ERROR, message, null);
   //    multi.add(status);
   //    log(multi);
   //  }
-  //  
+  //
   //  public static void log(Throwable e) {
   //    log(new Status(IStatus.ERROR, getPluginId(), JavaStatusConstants.INTERNAL_ERROR, JavaUIMessages.getString("JavaPlugin.internal_error"), e)); //$NON-NLS-1$
   //  }
@@ -216,15 +231,79 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     Status status = new Status(severity, PLUGIN_ID, IStatus.OK, message, null);
     log(status);
   }
+
+  public static void log(IStatus status) {
+    getDefault().getLog().log(status);
+  }
   public static void log(Throwable e) {
     log(new Status(IStatus.ERROR, PLUGIN_ID, IStatus.ERROR, "PHPeclipsePlugin.internalErrorOccurred", e)); //$NON-NLS-1$
   }
-  public static boolean isDebug() {
-    return getDefault().isDebugging();
+
+  private static void setJVM() {
+    String osName = System.getProperty("os.name");
+
+    if (osName.startsWith("Mac OS")) {
+      String mrjVersion = System.getProperty("mrj.version");
+      String majorMRJVersion = mrjVersion.substring(0, 3);
+      jvm = OTHER;
+      try {
+
+        double version = Double.valueOf(majorMRJVersion).doubleValue();
+
+        if (version == 2) {
+          jvm = MRJ_2_0;
+        } else if (version >= 2.1 && version < 3) {
+          jvm = MRJ_2_1;
+        } else if (version == 3.0) {
+          jvm = MRJ_3_0;
+        } else if (version >= 3.1) {
+          jvm = MRJ_3_1;
+        }
+
+      } catch (NumberFormatException nfe) {
+
+      }
+
+    } else if (osName.startsWith("Windows")) {
+      if (osName.indexOf("9") != -1) {
+        jvm = WINDOWS_9x;
+      } else {
+        jvm = WINDOWS_NT;
+      }
+    }
   }
 
-  static IPath getInstallLocation() {
-    return new Path(getDefault().getDescriptor().getInstallURL().getFile());
+  // TODO: refactor this into a better method name !
+  public synchronized PHPDocumentProvider getCompilationUnitDocumentProvider() {
+    if (fCompilationUnitDocumentProvider == null)
+      fCompilationUnitDocumentProvider = new PHPDocumentProvider();
+    return fCompilationUnitDocumentProvider;
+  }
+
+  /**
+   * Get the identifier index manager for the given project
+   * 
+   * @param iProject the current project
+   * @return
+   */
+  public IdentifierIndexManager getIndexManager(IProject iProject) {
+    String indexFilename = iProject.getLocation() + File.separator + "project.index";
+    IdentifierIndexManager indexManager = (IdentifierIndexManager) fIndexManagerMap.get(indexFilename);
+    if (indexManager == null) {
+      indexManager = new IdentifierIndexManager(indexFilename);
+      fIndexManagerMap.put(indexFilename, indexManager);
+    }
+    return indexManager;
+  }
+
+  public synchronized JavaTextTools getJavaTextTools() {
+    if (fJavaTextTools == null)
+      fJavaTextTools = new JavaTextTools(getPreferenceStore());
+    return fJavaTextTools;
+  }
+
+  public IFile getLastEditorFile() {
+    return fLastEditorFile;
   }
 
   /**
@@ -251,43 +330,62 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     // windows preferences:
     store.setDefault(LOCALHOST_PREF, "http://localhost");
 
+    store.setDefault(SHOW_EXTERNAL_PREVIEW_PREF, "true");
     store.setDefault(USE_EXTERNAL_BROWSER_PREF, "false");
     store.setDefault(SHOW_OUTPUT_IN_CONSOLE, "true");
+
+    String windowsSystem = BootLoader.getWS();
+
     if (jvm == WINDOWS_9x) {
       store.setDefault(EXTERNAL_BROWSER_PREF, "command.com /c start iexplore {0}");
-    } else if (jvm == WINDOWS_NT) {
+    } else if (windowsSystem.equals(BootLoader.WS_WIN32)) {
       store.setDefault(EXTERNAL_BROWSER_PREF, "rundll32 url.dll,FileProtocolHandler {0}");
+    } else if (windowsSystem.equals(BootLoader.WS_CARBON)) {
+      // TODO How do we start Safari on Mac OS X ?
+      store.setDefault(EXTERNAL_BROWSER_PREF, "netscape {0}");
     } else {
       store.setDefault(EXTERNAL_BROWSER_PREF, "netscape {0}");
     }
     store.setDefault(DOCUMENTROOT_PREF, getWorkspace().getRoot().getLocation().toString());
-    if ((jvm == WINDOWS_9x) || (jvm == WINDOWS_NT)) {
+
+    //  if ((jvm == WINDOWS_9x) || (jvm == WINDOWS_NT)) {
+    // 
+    if (windowsSystem.equals(BootLoader.WS_WIN32)) {
+      store.setDefault(PHP_RUN_PREF, "c:\\apache\\php\\php.exe");
       store.setDefault(EXTERNAL_PARSER_PREF, "c:\\apache\\php\\php -l -f {0}");
-      store.setDefault(MYSQL_PREF, "c:\\apache\\mysql\\bin\\mysqld.exe --standalone");
-      store.setDefault(APACHE_START_PREF, "c:\\apache\\apache.exe -c \"DocumentRoot \"{0}\"\"");
-      store.setDefault(APACHE_STOP_PREF, "c:\\apache\\apache.exe -k shutdown");
-      store.setDefault(APACHE_RESTART_PREF, "c:\\apache\\apache.exe -k restart");
+      store.setDefault(MYSQL_RUN_PREF, "c:\\apache\\mysql\\bin\\mysqld-nt.exe");
+      store.setDefault(APACHE_RUN_PREF, "c:\\apache\\apache.exe");
     } else {
+
+      store.setDefault(PHP_RUN_PREF, "/apache/php/php");
       store.setDefault(EXTERNAL_PARSER_PREF, "/apache/php/php -l -f {0}");
-      store.setDefault(MYSQL_PREF, "/apache/mysql/bin/mysqld --standalone");
-      store.setDefault(APACHE_START_PREF, "/apache/apache -c \"DocumentRoot \"{0}\"\"");
-      store.setDefault(APACHE_STOP_PREF, "/apache/apache.exe -k shutdown");
-      store.setDefault(APACHE_RESTART_PREF, "/apache/apache -k restart");
+      store.setDefault(MYSQL_RUN_PREF, "/apache/mysql/bin/mysqld");
+      store.setDefault(APACHE_RUN_PREF, "/apache/apache");
 
     }
+    store.setDefault(MYSQL_PREF, "--standalone");
+    store.setDefault(APACHE_START_PREF, "-c \"DocumentRoot \"{0}\"\"");
+    store.setDefault(APACHE_STOP_PREF, "-k shutdown");
+    store.setDefault(APACHE_RESTART_PREF, "-k restart");
+
+    store.setDefault(MYSQL_START_BACKGROUND, "true");
+    store.setDefault(APACHE_START_BACKGROUND, "true");
+    store.setDefault(APACHE_STOP_BACKGROUND, "true");
+    store.setDefault(APACHE_RESTART_BACKGROUND, "true");
 
     store.setDefault(PHP_PARSER_DEFAULT, PHP_EXTERNAL_PARSER);
     store.setDefault(PHP_INTERNAL_PARSER, "false");
     store.setDefault(PHP_EXTERNAL_PARSER, "true");
 
-    store.setDefault(PHP_PARSE_ON_SAVE, "true");
+    //    store.setDefault(PHP_PARSE_ON_SAVE, "true");
 
     // show line numbers:
-    store.setDefault(LINE_NUMBER_RULER, "false");
-    store.setDefault(FORMATTER_TAB_SIZE, "4");
+    //   store.setDefault(LINE_NUMBER_RULER, "false");
+    //    store.setDefault(FORMATTER_TAB_SIZE, "4");
 
     // php syntax highlighting
-    store.setDefault(PHP_USERDEF_XMLFILE, ""); //assume there is none  chooA
+    store.setDefault(PHP_USERDEF_XMLFILE, "");
+    //assume there is none  chooA
 
     PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_MULTILINE_COMMENT, PHPColorProvider.MULTI_LINE_COMMENT);
     PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_SINGLELINE_COMMENT, PHPColorProvider.SINGLE_LINE_COMMENT);
@@ -298,12 +396,42 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_TYPE, PHPColorProvider.TYPE);
     PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_STRING, PHPColorProvider.STRING);
     PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_DEFAULT, PHPColorProvider.DEFAULT);
-    PreferenceConverter.setDefault(store, PHP_EDITOR_BACKGROUND, PHPColorProvider.BACKGROUND);
-    PreferenceConverter.setDefault(store, LINKED_POSITION_COLOR, PHPColorProvider.LINKED_POSITION_COLOR);
-    PreferenceConverter.setDefault(store, LINE_NUMBER_COLOR, PHPColorProvider.LINE_NUMBER_COLOR);
-
-    store.setDefault(PREFERENCE_COLOR_BACKGROUND_SYSTEM_DEFAULT, "true");
-    PreferenceConverter.setDefault(store, PREFERENCE_COLOR_BACKGROUND, PHPColorProvider.BACKGROUND_COLOR);
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PHP_EDITOR_BACKGROUND,
+    //      PHPColorProvider.BACKGROUND);
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      LINKED_POSITION_COLOR,
+    //      PHPColorProvider.LINKED_POSITION_COLOR);
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      LINE_NUMBER_COLOR,
+    //      PHPColorProvider.LINE_NUMBER_COLOR);
+
+    //    // set default PHPDoc colors:
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PHPDOC_KEYWORD, 
+    //      PHPColorProvider.PHPDOC_KEYWORD);
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PHPDOC_LINK, 
+    //      PHPColorProvider.PHPDOC_LINK);      
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PHPDOC_DEFAULT, 
+    //      PHPColorProvider.PHPDOC_DEFAULT);
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PHPDOC_TAG, 
+    //      PHPColorProvider.PHPDOC_TAG);
+
+    //    store.setDefault(PREFERENCE_COLOR_BACKGROUND_SYSTEM_DEFAULT, "true");
+    //    PreferenceConverter.setDefault(
+    //      store,
+    //      PREFERENCE_COLOR_BACKGROUND,
+    //      PHPColorProvider.BACKGROUND_COLOR);
 
     //language stuff
     store.setDefault(RESOURCE_BUNDLE, LANGUAGE_DEFAULT);
@@ -314,10 +442,162 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
 
     store.setDefault(PHP_OUTLINE_CLASS, "true"); //$NON-NLS-1$
     store.setDefault(PHP_OUTLINE_FUNC, "true"); //$NON-NLS-1$
-    store.setDefault(PHP_OUTLINE_VAR, "true"); //$NON-NLS-1$ 
+    store.setDefault(PHP_OUTLINE_VAR, "true"); //$NON-NLS-1$
 
     TemplatePreferencePage.initDefaults(store);
-    new PHPSyntaxRdr(); //this will initialize the static fields in the syntaxrdr class
+    //this will initialize the static fields in the syntaxrdr class
+    new PHPSyntaxRdr();
+
+    PHPCore.initializeDefaultPluginPreferences();
+    PreferenceConstants.initializeDefaultValues(store);
+
+    externalTools.initializeDefaultPreferences(store);
+  }
+
+  private IWorkbenchPage internalGetActivePage() {
+    IWorkbenchWindow window = getWorkbench().getActiveWorkbenchWindow();
+    if (window != null)
+      return window.getActivePage();
+    return null;
+  }
+
+  private ImageDescriptorRegistry internalGetImageDescriptorRegistry() {
+    if (fImageDescriptorRegistry == null)
+      fImageDescriptorRegistry = new ImageDescriptorRegistry();
+    return fImageDescriptorRegistry;
+  }
+  /**
+       * Open a file in the Workbench that may or may not exist in the workspace.
+       * Must be run on the UI thread.
+       * @param filename
+       * @throws CoreException
+       */
+  public ITextEditor openFileInTextEditor(String filename) throws CoreException {
+
+    // reject directories
+    if (new File(filename).isDirectory())
+      return null;
+
+    IWorkbench workbench = PlatformUI.getWorkbench();
+    IWorkbenchWindow window = workbench.getWorkbenchWindows()[0];
+    IWorkbenchPage page = window.getActivePage();
+    IPath path = new Path(filename);
+
+    // If the file exists in the workspace, open it
+    IFile file = getWorkspace().getRoot().getFileForLocation(path);
+    IEditorPart editor;
+    ITextEditor textEditor;
+    if (file != null && file.exists()) {
+      editor = page.openEditor(file);
+      textEditor = (ITextEditor) editor.getAdapter(ITextEditor.class);
+    } else {
+      // Otherwise open the stream directly
+      if (page == null)
+        return null;
+      FileStorage storage = new FileStorage(path);
+      IEditorRegistry registry = getWorkbench().getEditorRegistry();
+      IEditorDescriptor desc = registry.getDefaultEditor(filename);
+      if (desc == null) {
+        desc = registry.getDefaultEditor();
+      }
+      IEditorInput input = new ExternalEditorInput(storage);
+      editor = page.openEditor(input, desc.getId());
+      textEditor = (ITextEditor) editor.getAdapter(ITextEditor.class);
+
+      // If the storage provider is not ours, we can't guarantee read/write.
+      if (textEditor != null) {
+        IDocumentProvider documentProvider = textEditor.getDocumentProvider();
+        if (!(documentProvider instanceof ExternalStorageDocumentProvider)) {
+          storage.setReadOnly();
+        }
+      }
+    }
+    return textEditor;
+  }
+  /**
+       * Open a file in the Workbench that may or may not exist in the workspace.
+       * Must be run on the UI thread.
+       * @param filename
+       * @param line
+       * @throws CoreException
+       */
+  public void openFileAndGotoLine(String filename, int line) throws CoreException {
+
+    ITextEditor textEditor = openFileInTextEditor(filename);
+    if (textEditor != null) {
+      // If a line number was given, go to it
+      if (line > 0) {
+        try {
+          line--; // document is 0 based
+          IDocument document = textEditor.getDocumentProvider().getDocument(textEditor.getEditorInput());
+          textEditor.selectAndReveal(document.getLineOffset(line), document.getLineLength(line));
+
+        } catch (BadLocationException e) {
+          // invalid text position -> do nothing
+        }
+      }
+    }
+  }
+
+  /**
+       * Open a file in the Workbench that may or may not exist in the workspace.
+       * Must be run on the UI thread.
+       * @param filename
+       * @param offset
+       * @throws CoreException
+       */
+  public void openFileAndGotoOffset(String filename, int offset, int length) throws CoreException {
+
+    ITextEditor textEditor = openFileInTextEditor(filename);
+    if (textEditor != null) {
+      // If a line number was given, go to it
+      if (offset >= 0) {
+        IDocument document = textEditor.getDocumentProvider().getDocument(textEditor.getEditorInput());
+        textEditor.selectAndReveal(offset, length);
+      }
+    }
+  }
+
+  public void openFileAndFindString(String filename, String findString) throws CoreException {
+
+    ITextEditor textEditor = openFileInTextEditor(filename);
+    if (textEditor != null) {
+      //               If a string was given, go to it
+      if (findString != null) {
+        try {
+          IDocument document = textEditor.getDocumentProvider().getDocument(textEditor.getEditorInput());
+          int offset = document.search(0, findString, true, false, true);
+          textEditor.selectAndReveal(offset, findString.length());
+
+        } catch (BadLocationException e) {
+          // invalid text position -> do nothing
+        }
+
+      }
+    }
+  }
+  public void setLastEditorFile(IFile textEditor) {
+    this.fLastEditorFile = textEditor;
+  }
+
+  /**
+   * @see org.eclipse.ui.plugin.AbstractUIPlugin#shutdown()
+   */
+  public void shutdown() throws CoreException {
+    super.shutdown();
+
+    //  externalTools.shutDown();
+    ColorManager.getDefault().dispose();
+
+    // save the information from the php index files if necessary
+    Collection collection = fIndexManagerMap.values();
+    Iterator iterator = collection.iterator();
+    IdentifierIndexManager indexManager = null;
+    while (iterator.hasNext()) {
+      indexManager = (IdentifierIndexManager) iterator.next();
+      indexManager.writeFile();
+    }
+
   }
 
   public void startup() throws CoreException {
@@ -325,5 +605,13 @@ public class PHPeclipsePlugin extends AbstractUIPlugin implements IPreferenceCon
     IAdapterManager manager = Platform.getAdapterManager();
     manager.registerAdapters(new PHPElementAdapterFactory(), PHPElement.class);
     manager.registerAdapters(new ResourceAdapterFactory(), IResource.class);
+    //  externalTools.startUp(); 
+    getStandardDisplay().asyncExec(new Runnable() {
+      public void run() {
+        //initialize the variable context manager
+        VariableContextManager.getDefault();
+      }
+    });
   }
+
 }
\ No newline at end of file